Трећи манастир саграђен на острвцима у Скадарском језеру (Црна Гора) је Морачник, задужбина Балше III Балшића, назван по истоименом острву, подигнут између 1404. и 1417. године. Први пут у изворима се помиње 1417. године у повељи Балше III, којом том манастиру поклања гумно соли. Морачник је убрзо опустео, а у изворима нема података о његовој даљој судбини.
Манастирска црква посвећена је Богородици, грађена у облику триконхоса (тролиста) и малих је димензија (дугачка 7.5 м, широка 4 м).
Црква је некад имала припрату, чији су остаци данас конзервирани. Поред цркве манастирски комплекс чине и конак, остаци трпезарије и четвороспратна кула са капелом.
На највишој тачки Морачника налази се мала једнобродна црква, највероватније настала када и Богородичин манастир.
Шездесетих и осамдесетих година 20. века Морачник је делимично рестауриран, а 1997. године обновљен је монашки живот у њему.
Морачник припада Митрополији црногорско-приморској СПЦ.